Unión Comercio es parte del Campeonato Regional Zona Centro, entre los años 1975 y 1981. Dos años después, consiguió su anhelo de jugar a nivel profesional aceptando la invitación de la Asociación de Central de Fútbol de participar en la Segunda División (hoy Primera B), siendo el segundo representante de la Provincia de Colchagua en la serie.
Antes de su estreno, sus socios -con la venía de Joaquín Muñoz García- deciden cambiarles el nombre a Unión Santa Cruz, participando en la serie hasta el año 1989.
Luego de años participando entre los torneos de Primera B y tercera división, los unionistas regresaron al profesionalismo en el año 2014, logrando el ascenso a la Segunda División de la mano del exvolante Jaime Riveros en conjunto con Renzo Yañez.
En la categoría de bronce, comenzó un proceso de consolidación del club a nivel profesional. La vuelta a la gloria llegaría el 8 de diciembre de 2018 cuando los dirigidos por Osvaldo Hurtado consiguen el título del Campeonato Segunda División, tras empatar 1-1 frente a General Velásquez, con tanto de Diego Huerta.
La Primera B lo esperaba después de 21 años, en donde nombres como Rodrigo Paillaqueo, Fidel Córdova, Luis Torres, Juan Carlos Gaete, Luca Pontigo y Diego Huerta, quedaron grabados en la hinchada santacruzana.
Deportes Santa Cruz sigue vigente, tal como lo expresó el mítico Joaquín Muñoz García en sus inicios y hoy, el elenco dirigido por Fabián Marzuca es uno de los equipos participantes del Ascenso Betsson.